Marvel Ultimate Alliance Xbox 360De game volgt de zogenaamde Marvel Civil War verhaallijn, waarbij je de keuze hebt te vechten aan de Pro Registration of Anti Registration zijde. Dit vechten doe je met meerdere superhelden tegelijk, waarmee je verschillende levels doorloopt en het opneemt tegen allerlei slechteriken. Elke superheld heeft zijn of haar eigen vechtstijl, combo? s en speciale aanvallen tot de beschikking.